Classificado à terceira fase da Copa do Brasil, o Cuiabá ficou no pote 1 e vai evitar os principais clubes do Brasil no sorteio dos confrontos. O Dourado é o 19º no ranking de clubes da CBF e contou com algumas eliminações para ficar com a última vaga entre as 16 equipes melhores ranqueadas.
Os clubes do pote 1 obrigatoriamente precisam enfrentar adversários do pote 2. A partir de agora os confrontos passam a ser realizados com jogos de ida e volta, e serão definidos em sorteio na CBF, com data ainda a ser confirmada.
O Cuiabá não poderá enfrentar nesta terceira fase os times que vieram da Libertadores, por exemplo. Estão no mesmo pote que o Dourado, portanto não poderão ser o adversário são Flamengo, Palmeiras, São Paulo, Athletico-PR, Atlético-MG, Corinthians, Fluminense, Grêmio, Fortaleza, Internacional, Bahia, Botafogo, Red Bull Bragantino, Atlético-GO e Ceará.
Os possíveis adversários do Cuiabá são Goiás, Vasco, Juventude, Sport, CRB, Vitória, Criciúma, Sampaio Corrêa, Operário-PR, Botafogo-SP, Brusque, Ypiranga-RS, América-RN, Amazonas, Águia de Marabá e Sousa-PB. Essas equipes pertencem ao pote 2.
